From 78b82192a13ae9cca5c67b89be7e5eda586e7cf0 Mon Sep 17 00:00:00 2001 From: flt6 <1404262047@qq.com> Date: Wed, 20 Aug 2025 10:27:38 +0800 Subject: [PATCH] update --- mw_tool/{main.py => main_old.py} | 56 +-------------- mw_tool/pubchem_tool.py | 120 +++++++++++++++++++------------ 2 files changed, 77 insertions(+), 99 deletions(-) rename mw_tool/{main.py => main_old.py} (92%) diff --git a/mw_tool/main.py b/mw_tool/main_old.py similarity index 92% rename from mw_tool/main.py rename to mw_tool/main_old.py index b8449b4..bcf1511 100644 --- a/mw_tool/main.py +++ b/mw_tool/main_old.py @@ -60,31 +60,6 @@ def calculate_molecular_weight_from_smiles(smiles): st.error(f"SMILES分子量计算错误: {str(e)}") return None -def generate_molecule_image(inchi=None, smiles=None): - """从SMILES生成分子结构图""" - return None - try: - if inchi: - mol = Chem.MolFromInchi(inchi) - elif smiles: - mol = Chem.MolFromSmiles(smiles) - else: - st.error("必须提供InChI或SMILES字符串") - return None - if mol: - # 生成分子图像 - img = Draw.MolToImage(mol, size=(300, 300)) - # 将图像转换为字节流 - img_buffer = BytesIO() - img.save("a.png") - img.save(img_buffer, format='PNG') - img_buffer.seek(0) - return img_buffer - else: - return None - except Exception as e: - st.error(f"分子结构图生成错误: {str(e)}") - return None def get_pubchem_properties(compound): """从PubChem获取密度、熔点、沸点信息""" @@ -144,16 +119,6 @@ def get_pubchem_properties(compound): 'boiling_point': None } -def is_liquid_at_room_temp(melting_point): - """判断常温下是否为液体（假设常温为25°C）""" - if melting_point is None: - return False - try: - mp = float(melting_point) - return mp < 25 # 熔点低于25°C认为是液体 - except: - return False - def sync_calculations(compound_data, mmol=None, mass=None, volume=None, changed_field=None): """同步计算mmol、质量、体积""" if not compound_data: @@ -315,18 +280,7 @@ with col2: st.markdown("### 其他数据") st.page_link(f"https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/{data['cid']}",label="**访问PubChem**") st.image(f"https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/image/imgsrv.fcgi?cid={data['cid']}&t=s","结构式") - # st.button("访问PubChem",on_click=lambda :st.dire) - # if data['melting_point']: - # st.metric("熔点 (°C)", data['melting_point']) - # # 显示分子结构图 - # if data.get('inchi') or data.get('smiles'): - # st.markdown("分子结构图") - # mol_img = generate_molecule_image(inchi=data['inchi'], smiles=data['smiles']) - # if mol_img: - # st.image(mol_img, caption="分子键线式结构图", width=150) - # else: - # st.info("无法生成分子结构图") - + # 添加熔沸点信息的展开区域 if data.get('melting_point_src') or data.get('boiling_point_src'): with st.expander("熔沸点信息", expanded=False): @@ -357,9 +311,6 @@ with col2: melting_point = re.search(r'\d*\.\d+', melting_data[0]) if melting_point: melting_point = float(melting_point.group()) - is_liquid = is_liquid_at_room_temp(melting_point) - else: - is_liquid = False # 检测值变化并执行计算 def handle_change(field_name, new_value, current_value): @@ -427,10 +378,7 @@ with col2: # 密度显示选项 show_density = False if data['density_src']: - if is_liquid: - show_density = st.checkbox("显示密度信息", value=True) - else: - show_density = st.checkbox("显示密度信息", value=False) + show_density = st.checkbox("显示密度信息", value=False) if show_density: import re diff --git a/mw_tool/pubchem_tool.py b/mw_tool/pubchem_tool.py index 4a9b3d0..71bbf5a 100644 --- a/mw_tool/pubchem_tool.py +++ b/mw_tool/pubchem_tool.py @@ -203,8 +203,39 @@ def calculate_properties(molecular_weight: float, amount_mmol: Optional[float] = def reaction_table_page(): """反应表格页面""" - st.header("⚗️ 反应表格") - + st.header("反应表格") + + with st.expander("**使用说明**", expanded=False): + st.markdown('''在下方的表格中，您可以输入反应数据，程序会尝试计算其余各项。当量为0时，该物质不参与当量计算。 +### 立即计算 + +选中`立即计算`选项后，输入后立即尝试计算修改部分，您可以实时查看计算结果。但请注意，请勿同时修改多项内容。如果输入某项后计算未正确进行，这是潜在的缺陷，请反馈。 + +不保证在您主动修改计算结果后程序能正确处理（例如，程序算出质量后您主动修改），通常这会伴随着警告，但也有可能遗漏某些情况。 + +### 延迟计算 + +不选中`立即计算`后，在完成输入后，您可以点击“计算”按钮，程序会尝试计算所有可用的结果。 + +程序在计算时会检查是否有冗余数据，例如同时给定分子量、用量、质量，并拒绝在这种情况下计算。您可以选中`不使用检查`选项来禁用检查，但请保证数据自洽（即使得所有已知量之间的关系成立），否则会发生未定义行为。 + +如果计算后您想要修改或补充内容再次计算，请选中`不使用检查`选项。 +''') + with st.expander("关于未定义行为"): + st.markdown('''程序内部计算顺序为 +1. n -> mass +2. mass -> n +3. mass -> volumn +4. volumn -> mass +5. mass -> n +6. eqiv -> n +7. n -> mass +8. mass -> volumn + +如果存在不自洽的数据，您可以通过上述内容预测程序行为。但这不应该在实际使用中依赖，因为在不同版本下实现可能发生变化。 + +''') + # 初始化数据 if 'reaction_data' not in st.session_state: df = pd.DataFrame([[None,None,None,None,None,None,None,None]],columns=[ @@ -222,12 +253,11 @@ def reaction_table_page(): st.session_state.reaction_data = df - st.write("### 反应物质表格") - use_on_change = st.checkbox("是否立即计算", value=True) - st.info(f"💡 当量为0时，该物质不参与当量计算。"+("如果保证表格已有内容自洽，可选中不使用检查。" if not use_on_change else "")) + st.info(f"💡 当量为0时，该物质不参与当量计算。") + use_on_change = st.checkbox("立即计算", value=True) if not use_on_change: - st.button("计算",on_click=calc_reaction_data) st.checkbox("不使用检查", value=False,key="no_check",) + st.button("计算",on_click=calc_reaction_data,type="primary") # 使用data_editor创建可编辑表格 edited_data = st.data_editor( @@ -359,7 +389,17 @@ def calc_reaction_data(): fil = df["rho"].notna() & df["mass"].notna() & eqfil df.loc[fil, "vol"] = df[fil]["mass"] / df[fil]["rho"] # g -> mL，再除以 g/mL - df.columns = [ + + + except Exception as e: + # if "df" in locals(): + # st.session_state.reaction_data = df + st.error("计算过程中出错，表格可能有误") + print("calc_reaction_data error:", traceback.format_exc()) + return + finally: + if "df" in locals(): + df.columns = [ "物质", "分子量", "当量", @@ -368,15 +408,8 @@ def calc_reaction_data(): "密度(g/mL)", "体积(mL)", "备注" - ] - st.session_state.reaction_data = df - - except Exception as e: - if "df" in locals(): + ] st.session_state.reaction_data = df - st.error("计算过程中出错，表格可能有误") - print("calc_reaction_data error:", traceback.format_exc()) - return def recalculate_reaction_data(): """根据最近一次编辑的行及当量，推算其他未编辑行的用量，并更新质量/体积。""" @@ -579,8 +612,31 @@ def add_compound_to_reaction(compound:PubChemCompound): def compound_search_page(): """化合物搜索页面""" # 输入区域 - st.header("📝 输入查询条件") - + + + with st.expander("**使用说明**"): + st.markdown(""" + 1. **选择搜索类型**: + - 名称: 输入化合物的常用名称或IUPAC名称 + - 化学式: 输入分子式 (如 C2H6O) + - SMILES: 输入SMILES字符串 (如 CCO) + + 2. **输入查询条件**: 在输入框中输入相应的查询词 + + 3. **点击搜索**: 系统将从PubChem数据库中查询匹配的化合物 + + 4. **查看结果**: + - 基本信息包括名称、化学式、分子量和2D结构图 + - 密度和熔沸点信息可在展开区域查看 + - 计算器可帮助您计算用量、质量和体积的关系 + + ### 示例查询 + - **名称**: ethanol, water, glucose + - **化学式**: C2H6O, H2O, C6H12O6 + - **SMILES**: CCO, O, C(C1C(C(C(C(O1)O)O)O)O)O + """) + + st.header("查询条件") col1, col2 = st.columns([1, 2]) with col1: @@ -802,45 +858,19 @@ def compound_search_page(): st.rerun() else: st.warning("无分子量数据，无法进行计算") + - else: - # 显示使用说明 - st.info("👈 请在左侧输入化合物信息开始查询") - - st.markdown(""" - ### 🔍 使用说明 - - 1. **选择搜索类型**: - - 名称: 输入化合物的常用名称或IUPAC名称 - - 化学式: 输入分子式 (如 C2H6O) - - SMILES: 输入SMILES字符串 (如 CCO) - - 2. **输入查询条件**: 在输入框中输入相应的查询词 - - 3. **点击搜索**: 系统将从PubChem数据库中查询匹配的化合物 - - 4. **查看结果**: - - 基本信息包括名称、化学式、分子量和2D结构图 - - 密度和熔沸点信息可在展开区域查看 - - 计算器可帮助您计算用量、质量和体积的关系 - - ### 📝 示例查询 - - **名称**: ethanol, water, glucose - - **化学式**: C2H6O, H2O, C6H12O6 - - **SMILES**: CCO, O, C(C1C(C(C(C(O1)O)O)O)O)O - """) def main(): st.set_page_config( - page_title="PubChem化合物查询工具", + page_title="有机合成用量计算工具", page_icon="🧪", layout="wide" ) # 侧边栏导航 with st.sidebar: - st.title("🧪 化学工具") page = st.radio( "选择功能页面", ["化合物查询", "反应表格"],